Для сжатия диска достаточно воспользоваться одной командой.
Имейте в виду! Не забывайте остановить виртуальную машину! Запуск этой команды при запущенной виртуальной машине категорически запрещен!
qemu-img convert source_not_compressed_qcow2.img -O qcow2 -c target_compressed_qcow2.img